UGENE - Ferramenta livre de bioinformática para análise de DNA e proteínas


UGENE é um software open source multi-plataforma de bioinformática. Possui um editor de anotação visual para sequências de DNA e proteínas, suporte para uma série de formatos populares de dados de bioinformática, visualização e edição de cromatogramas, suporta pedidos de BLAST e serviços CDD, alinhamento de sequências múltiplas com porta gráfica de MUSCLE3, CLUSTAL, MAFFT, T-CAFÉ e ferramentas KAlign, pesquisa com perfis HMM usando a interface gráfica para pacotes HMMER2 e HMMER3, visualizador de proteína molecular3D e de estrutura de DNA para o formato PDB.

Você terá disponível um visualizador de montagem, tradução e retroversão de alfabetos de DNA e proteínas, designer de fluxo de trabalho para construir complexo reutilizáveis, pesquisar em sites o fator de transcrição de ligação (TFBS) em seqüências de DNA e etc etc e etc. O programa está nos repositórios oficiais do Ubuntu.

INSTALAÇÃO MODO GRÁFICO

1 - Abra a Central de Programas do Ubuntu;
2 - Na Central de Programas, no campo de pesquisa pesquise pelo nome do programa;
3 - Faça clique-simples sobre o primeiro resultado para visualizar mais opções;
4 - Clique no botão "Instalar" para iniciar o processo. A senha de administrador será solicitada, digite-a e clique no botão "Autenticar" para prosseguir;
5 - Isto pode demorar um pouco. Aguarde...;
6 - Quando o processo de instalação for concluído, feche a Central de Programas.

INSTALAÇÃO MODO TEXTO

Para instalar basta abrir um terminal (CTRL+ALT+T) e digitar o seguinte comando:

$ sudo apt-get install ugene + enter
 
Ou faça o download neste link.

disponível para:
página do projeto: ugene.unipro.ru
Fonte e Créditos: aqui

0 comentários:

O conteúdo deste blog/site pode e deve ser divulgado, conforme lei a 9.610/98 meus direitos estão assegurados, portanto eu permito a copia e reprodução gratuita, seja total ou parcial, não acarretando qualquer onûs financeiro aos interessados, porém, vedo o uso para fins lucrativos, toda reprodução para o público deve citar a fonte extraída, no caso o Técnico Linux - O Espaço do Software Livre e seja citada junto com um link para a postagem original, onde a referência deve estar numa fonte de tamanho igual ou maior a do texto, obviamente que os links citados não estão sujeitos ao mesmo termo. O conteúdo textual original desta página está disponível sob a licença GNU FDL 1.2.

Todas as marcas citadas pertencem aos seus respectivos proprietários. Os direitos autorais de todas as ilustrações pertencem aos respectivos autores, e elas são reproduzidas na intenção de atender ao disposto no art. 46 da Lei 9.610 - se ainda assim alguma delas infringe direito seu, entre em contato para que possamos removê-la imediatamente ou ainda lhe dar os devidos créditos.

Copyright © 2016 O Espaço do Software Livre